協力大学とは、国連大学私費留学生育英資金貸与事業の目的と意図に賛同し、在学中の私費留学生に当該資金を貸与するため、国連大学との間で協力大学契約を締結した個別の大学か短期大学(国公私立を問わない)またはその総称です。各協力大学は契約締結後、受給学生の募集や事前選考、学生からの資金返還の受付およびモニタリングなど、重要な役割を担います。
現在、以下の大学・短期大学36校が協力大学として当事業に参加しています。そして、2003年3月の事業開始以来、851人の留学生に育英資金が貸与されています(2009年6月現在)。

| 協力大学 (50音順) |
これまでの 貸与学生数合計 (貸与決定者含む) |
2009年の募集時期 | 各大学担当窓口 |
| 愛知産業大学 | 22名 | 2009年6月 2009年12月 |
国際交流室 |
| 秋田大学 | 43名 | 2009年5月 2009年11月 |
国際交流課 |
| 桜美林大学 | 8名 | 2009年4月 2009年9月 |
学生課 |
| 大阪工業大学 | 5名 | 2009年10月 | 学生部 学生課 |
| 沖縄国際大学 | 34名 | 2010年2月 | 国際交流センター |
| 沖縄大学 | 6名 | 2009年7月 2010年1月 |
教務課 国際交流室 |
| 帯広畜産大学 | 2名 | 2009年4月 2009年10月 |
学務課 留学生担当 |
| 金沢星稜大学 | 80名 | 2009年3月 2009年9月 | 教学課 |
| 共愛学園前橋国際大学 | 10名 | 2009年4月 2009年10月 |
教務学生課 |
| 京都工芸繊維大学 | 2009年2月より参加 | 2009年5月 2009年10月 |
国際企画課 |
| 金城大学 金城大学短期大学部 |
12名 | 2009年4月 2009年10月 |
国際交流センター |
| 広島文化学園大学 (旧:呉大学) |
95名 | 2009年4月 2010年10月 | 郷原・坂キャンパス 留学生課 |
| 埼玉大学 | 10名 | 2009年4月 2009年10月 |
国際交流支援室 |
| 城西国際大学 | 8名 | 2009年4月 2009年9月 |
国際教育センター 留学生センター |
| 津田塾大学 | 5名 | 2009年4月 2009年9月 |
国際センター |
| 東京基督教大学 | 16名 | 2009年4月 2009年9月 |
学生課 |
| 富山国際大学 | 30名 | 2009年6月 2009年9月 |
国際交流センター |
| 豊橋技術科学大学 | 1名 | 2009年5月 2009年10月 |
国際交流課 |
| ノースアジア大学 | 3名 | 2009年4月 | 教務課 |
| 梅光学院大学 | 2009年2月より参加 | 2009年6月 | 国際交流センター |
| プール学院大学 | 17名 | 2009年4月 2009年10月 |
学生課 |
| フェリス女学院大学 | 28名 | 2009年4月 2009年10月 |
海外交流課 |
| 文化女子大学 | 41名 | 2009年6月 |
事務局 学生部学生課 |
| 文化女子短期大学部 | 1名 | 2009年6月 |
事務局 学生部学生課 |
| 北陸大学 | 100名 | -- | 学生課 学生総合サービスセンター |
| 北海道情報大学 | 2008年1月より参加 | -- | 学生サポートセンター 事務室 |
| 宮崎公立大学 | -- | 2009年7月 | 学務課学生係 |
| 宮崎大学 | 11名 | 2009年4月 2009年10月 |
グロ-バルサポ-ト室 国際交流課 |
| 室蘭工業大学 | 20名 | 2009年4月 2009年9月 |
国際交流センター |
| 目白大学 目白大学短期大学部 |
13名 | 2009年4月 2009年7月 |
学生支援部 学生サービスグループ |
| 横浜商科大学 | 18名 | 2009年4月 2009年9月 |
学務部 留学生担当 |
| 立命館大学 | 2名 | 2009年6月 2009年12月 | 国際部 |
| 立命館アジア太平洋大学 | 160名 | 2009年4月〜5月 2009年10月〜11月 |
アドミッションズ・オフィス (入学前) スチューデント・オフィス (入学後) |
| 流通科学大学 | 49名 | 2009年5月 2009年10月 |
アジア流通 研究センター |
| その他 |
1名 | - |
- |
| Total | 851名 |